----- 熊本市 -----
高橋稲荷神社
（たかはしいなりじんじゃ）
鎮座地：熊本市西区上代
御祭神：宇迦之御魂神
備考：別表神社
藤崎八幡宮
（ふじさきはちまんぐう）
鎮座地：熊本市中央区井川淵町
御祭神：應神天皇（一宮）、住吉大神（二宮）、神功皇后（三宮）
備考：別表神社
出水神社（いみずじんじゃ）
鎮座地：熊本市中央区水前寺公園
御祭神：細川藤孝卿、細川忠興卿、細川忠利卿、細川重賢卿 配座：細川玉ほか10柱
(左)通常の御朱印
(右)細川玉（ガラシャ）さんのシルエット入り
加藤神社（かとうじんじゃ）
鎮座地：熊本市中央区本丸
御祭神：加藤清正公、陪神：大木兼能、韓人金宦公
熊本城稲荷神社
（くまもとじょういなりじんじゃ）
鎮座地：熊本市中央区本丸
御祭神：白髭大明神
熊本大神宮
（くまもとだいじんぐう）
鎮座地：熊本市中央区本丸
御祭神：天照皇大神,豊受大神 配祀：天之御中主神,高御産巣日神,倭日売命,神御産巣日大神
熊本県護国神社
（くまもとけんごこくじんじゃ）
鎮座地：熊本市中央区宮内
御祭神：熊本県の英霊
備考：別表神社
新宮神社（しんみやじんじゃ）
鎮座地：熊本市中央区宮内
御祭神：田道間守命
備考：熊本県護国神社の境内社
----- 阿蘇市 -----
阿蘇神社（あそじんじゃ）
鎮座地：阿蘇市一の宮町宮地
御祭神：健磐龍命、阿蘇都比咩命、国造速瓶玉命
備考：肥後国一宮、別表神社
----- 人吉市 -----
青井阿蘇神社
（あおいあそじんじゃ）
鎮座地：人吉市上青井町
御祭神：健磐龍命、阿蘇津媛命、國造速甕玉命
備考：別表神社
----- 八代市 -----
八代宮（やつしろぐう）
鎮座地：八代市松江城町
御祭神：懐良親王
配祀：良成親王
備考：建武中興十五社、別表神社
八代神社（やつしろじんじゃ）
鎮座地：八代市妙見町
御祭神：天之御中主神、国常立尊
----- 菊池市 -----
菊池神社（きくちじんじゃ）
鎮座地：菊池市隈府
御祭神：菊池武時公、菊池武重公、菊池武光公
備考：建武中興十五社、別表神社
城山神社（しろやまじんじゃ）
鎮座地：菊池市隈府
御祭神：菊池武房公、菊池重朝公
備考：菊池神社の摂社
城山生日稲荷神社
（しろやまいきめいなりじんじゃ）
鎮座地：菊池市隈府
御祭神：倉稲魂神、生目の神
備考：菊池神社の末社
雲上宮（くものうへぐう）
鎮座地：菊池市隈府
御祭神：懐良親王、良成親王
備考：菊池神社の別宮
